Отмечена важность матричного анализа профессора С. Петухова в генетическом кодировании. Одновременно высказаны сомнения по поводу его "золотой" геноматрицы с искусственным внедрением константы золотого сечения Ф. Приведены наборы числовых матриц, позволяющих обосновать количество аминокислот 20 в генетическом коде, как максимально возможное число сочетаний с повторениями из четырех азотистых оснований по их триплетам.

Оглавление

Вместо вступления

Введение в тему

Кронекерово произведение и комбинаторные соединения

Числовая кодировка ДНК

Числовые матрицы С. Петухова

Лукавство или заблуждение...

О константе золотого сечения в генетике

Альтернативная кодировка

Матрица из начальных чисел Фибоначчи

Матрица из чисел Люка

Дискуссионные моменты

Почему число генетически кодируемых аминокислот равно 20?

Тетраэдрические числа

Моделирование кронекеровой суммой

Числа 2 и 3

Вместо заключения

Литература

Приложение 1. Таблица Никомаха

Приложение 2. Игровая модель магического квадрата

Вместо вступления

В определенном контексте настоящая статья является продолжением публикации [1] о квази- и псевдозолотых моделях.

Прежде всего, с её смыслом о неплохом обыкновении, время от времени перечитывать, осознавать и переосмысливать некоторые работы и целые направления развития науки.

Вещь полезная и поучительная. Тем более, любое новое рождается на уже известной базе либо с её учетом.

Преемственность – одно из необходимых условий.

Как листочек на дереве немыслим без корня, ствола и веточки.

Причем не успел листок распуститься, как за ним уже видна новая почка. И так далее...

Важными моментами в золотоносной тематике остаются принятые положения-определения [1]:

• квазиЗС – модель, в основе которой лежит вполне конкретное число, близкое к константе золотого сечения (ЗС);
• псевдоЗС – модель, в основу которой искусственно и бездоказательно внедряется золотая пропорция.

Одновременно представляемый ниже материал имеет самостоятельное значение, в том числе в развитие подходов к разработке и осмыслению матричных методов в генетике.

Введение в тему

Возможный механизм кодирования ДНК путем матричного синтеза впервые прозвучал в работе [2] с указанием на то, что определенная последовательность оснований является кодом, который несет генетическую информацию.

Ключ к последующим расшифровкам генетического кода был найден благодаря проницательным концепциям Ф. Крика [3, с. 38], который предложил теоретическую модель двойной спирали ДНК.

Чуть позже американский физик Г. Гамов впервые поставил задачу генетического кода. Он предположил, что структура белков, состоящих из 20 основных аминокислот, зашифрована в последовательности из четырех возможных нуклеотидов, входящих в состав молекулы ДНК [4], и высказал мысль об их кодировании триплетами (кодонами) последовательных нуклеотидов (лат. triplus тройной).

И уже в 1965 г. был установлен смысл всех 64 триплетов. Оказалось, что некоторые кодоны просто-напросто избыточны. То есть целый ряд аминокислот кодируется двумя, четырьмя или даже шестью триплетами.

Не так давно на АТ "достали с полки" замечательную монографию проф. С. Петухова (2008) [5]. Книга, безусловно, интересная, новаторская, достойная широкой популяризации и любезно представленная автором в открытом доступе, включая личный сайт.

Её вторичная актуализация как бы задает новый импульс в осмыслении злободневной проблематики по генетическому кодированию информации. Включая эффективное представление генетических мультиплетов в форме единого семейства кронекеровых генетических матриц. Тем более, по некоторым восторженным оценкам: «Наверное, в мире нет более глубокого специалиста в области генетического кодирования» (Топос, 25.09.2013).

Некоторые украинские авторы [6] даже прослеживают в работе Петухова [5] элементы «теории искусственных нейронных сетей».

Тематика книги достаточно обширная и во многом помогает «мировоззренчески осмыслить вопросы об устройстве мироздания» [7].

Мы ограничимся анализом исследований Петухова в несколько дискуссионном ключе под углом зрения: роли-значимости золотого сечения (ЗС) в его "матричной генетике".

С последующим развитием задачи в части числового моделирования.

Но сначала несколько слов о произведении Кронекера, комбинаторных соединениях и числовой кодировке ДНК.

формате PDF (1170Кб)